ФАС возбудило в отношении этой авиакомпании дело по признакам нарушения закона о конкуренции. Его инициатором стал один из главных конкурентов «КрасЭйр» - новосибирская авиакомпания «Сибирь». Несмотря на полученное от Росавиации разрешение организовать рейсы из красноярского аэропорта Емельяново (аэропорт входит в состав авиакомпании «КрасЭйр») в Москву, «Сибири» так и не удалось договориться с «КрасЭйр» о начале полетов по выгодному маршруту, которые она собиралась открыть еще в июне.
В самой «КрасЭйр» все обвинения в свой адрес считают надуманными и ничем не обоснованными. Понятно, что разбирательства займут какое-то время. Но уже сейчас «Сибирь» нашла способ насолить своему обидчику. Для жителей Красноярска «Сибирь» на свои рейсы из Новосибирска установила половинный тариф. Получается, что, даже, несмотря на поездку до Новосибирска на поезде, лететь из соседнего аэропорта будет дешевле, чем из Красноярска.